Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的检测,转基因动植物转基因拷贝数的检测,RNAi基因失活率的检测等;2.基因表达差异分析:例如比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异(如药物处理、物理处理、化学处理等),特定基因在不同时相的表达差异以及cDNA晶片或差显结果的确证;3.基因分型:例如SNP检测,甲基化检测等。Real-time PCR常用的两种方法分别为Sybrgreen(萤光染料掺入法)和Taqmanprobe(探针法)。实时荧光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有两种策略。宁波微量RT-PCR检测技术研究方案
Real-time PCR相对定量中的标准曲线法如何进行:主要是相对定量标准品的制作,一般有三种方法:1、比较复杂的方法:质粒,采用Biotnt提供内参基因的特异性Real-time PCRmRNA引物,对目的基因进行Real-time PCR实验,得到PCR扩增产物;PCR扩增产物转入质粒中,得到相对定量的标准品;2、一般采用的方法1:比较强的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR扩增产物,如果在方法2中找不到比较强的CDNA模板,则选用PCR产物作为相对定量的标准品也是可以的;需要注意的事项是:PCR产物浓度很高,而Real-time PCR的产物片段比较短,容易在稀释的过程中造成PCR污染,要注意操作。厦门实时数字PCR方案聚合酶链反应允许快速生产短DN段,即使已知的引物序列不超过两个。
Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反应体系中加入荧光物质,然后通过荧光化学物质监测每次PCR反应循环后产物总量的方法,之后通过内参法或外参法对待测样品中的特定DNA序列(目的基因)进行定量分析的方法。实验过程中,这些荧光物质可以在激发光的作用下释放出一定波长的发射光,定量用PCR仪通过对这些发射光进行实时监测,较终可以描绘出整个PCR的反应过程,这就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR链式反应:DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。但是,DNA聚合酶在高温时会失活。
Real-time PCR:所谓Real-time PCR技术,是指在PCR反应体系中加入萤光基团,利用萤光信号累积实时监测整个PCR进程,之后通过标準曲线对未知模板进行定量分析的方法。利用萤光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标準曲线的分析对起始模板进行定量分析。Real-time PCR技术即实时萤光定量PCR避免了传统PCR以终产物监测定量产生的偏差,提高实验的重複性。该技术已经被普遍用于监测细胞mRNA表达量的变化;比较不同组织的mRNA表达差异;验证基因晶片,siRNA干扰的实验结果。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。
Real-time PCR链反应:嵌套聚合酶链反应:通过减少DNA非特异性扩增的背景,提高DNA扩增的特异性。两组引物用于两个连续的PCR。在个反应中,一对引物用于产生DNA产物,除了预期的靶之外,该产物可能仍然由非特异性扩增的DN段组成。然后用一组引物将产物用于第二次聚合酶链反应,所述引物的结合位点完全或部分不同于次反应中使用的每个引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特异性扩增长DN段方面通常比传统PCR更成功,但它需要更详细的目标序列知识。重叠延伸聚合酶链反应或者通过重叠延伸拼接(SOEing):一种用于将两个或多个含有互补序列的DN段拼接在一起的基因工程技术。它用于连接含有基因、调节序列或突变的DN段;这项技术可以创造特定的长DNA构建体。它还可以将缺失、插入或点突变引入DNA序列。Real-time PCR在实验内参的设定主要为了用于靶RNA的定量。武汉细胞定量PCR服务
PCR反应的很大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性。宁波微量RT-PCR检测技术研究方案
Real-time PCR式反应准备:10×扩增缓冲液、4种dNTP混合物(终浓度)、引物(终浓度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(终浓度)、补加双蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或浓度)可根据实验调整,以上表格只提供大致参考值。PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DN段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。宁波微量RT-PCR检测技术研究方案
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Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析:定量分析可以分为定量和相对定量两种。定量指的是我们想知道某个基因在初始样品中具体的拷贝数或浓度是多少?定量实验必须使用已知拷贝数的标准品,必须做标准曲线。而相对定量是指我们想知道某一个基因在不同样品中表达量的差异,其目的是测定目的基因在两个或多个样本中的含量的相对比例,而不需要知道它们在每个样本中的拷贝数。举例来说,如研究项目中包括使用高盐胁迫处理的样本和未高盐胁迫处理的样本,记为已处理样本和未处理样本,通常可以将未处理样本指定为基准,规定其目的基因浓度为100%,用已处理样本的定量结果除以未处理样本的定量结果,就可以计算每个已处...