基因疗法制造商面临的挑战与抗体疗法刚出现时单克隆抗体制造商面临的挑战相似。例如，在生产、储存和处理过程中，单克隆抗体也会受到低滴度、产品和工艺相关杂质和降解的挑战。尽管与重组单克隆抗体相比，单剂量AAV产品与工艺相关杂质相关的风险可能更低（取决于杂质的类型、剂量和给药途径），但这也不能忽视。由于这些相似性，制药商、化学品和辅料供应商有机会进行合作，并开发创新的解决方案，以实现稳健和成本效益高的AAV产品生产。SAN HQ高盐核酸酶在高盐浓度下具有较高活性。天津上海倍笃生物高盐核酸酶70921-202
ArcticZymes Technologies致力于提供高质量产品，具有良好的批间一致性、稳定可靠的质量、及时的文件及技术支持。ArcticZymes所有产品的开发、生产及销售等都符合ISO13485:2016质量管理体系标准；鉴于生物制品更严格的质控要求，厂家对盐活性核酸酶系列产品（Salt Active Nucleases，SANs）的生产及质控，在符合ISO13485:2016体系基础上，增加了cGMP相应要求，如生产用原辅料是Non-animal和Non-plant来源的，终产品经过0.22µm过滤sterilization，放行检测包括microbes、fungus及内毒检测等，所有标准符合USP-EP要求。江西SAN HQ TF高盐核酸酶70921-150SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP级别高盐核酸酶，于2023年Q4上市。
相比传统的Benzonase核酸酶，SAN HQ高盐核酸酶的优势是在400mM-600mM盐浓度条件下具有适宜酶活性。在这个条件下，AAV病毒载体聚集更少、更加稳定；SAN HQ的使用能够简化生产工艺、降低酶用量及成本，不需额外脱盐操作；AAV病毒载体得率更高，且HCD残留更少、AAV产物更稳定。曲光教授在2005年发表的文章中，以AAV2为例探讨了引起AAV病毒聚集的因素，并探索了AAV病毒纯化和制剂过程中抑制聚集的方法。该文章通过筛选发现，高盐浓度能够抑制AAV病毒团聚，让AAV病毒更加稳定，且高盐浓度并不削弱AAV病毒的侵染活性。
从国内来看，由于 AAV 基因药物研发管线绝大部分集中在眼科遗传病上，载体用量较小，三质粒共转染 AAV 系统足以满足未来的临床及商业需求，因此，国内的 AAV 生产系统主要以三质粒为主。然而，考虑到未来 AAV 基因药物在血液、神经系统、肌肉系统等领域的临床应用，三质粒系统显然难以胜任。如药明生基从国外收购了 OXGENE 的辅助腺病毒 AAV 生产系统 TESSA，据报道较三质粒系统有10倍的提升；而基因药物 CDMO 企业北京五加和基因则在国内率先采用了陈海峰博士的威洛克公司授权的Bac-to-AAV 系统，凭借公司在病毒载体领域持续30年的研发经验，不断摸索、试验，终于在临床级生产方面获得了巨大的成功，为 AAV 基因药物管线研发公司锦篮基因进行多批次临床 CDMO 代工生产。ArcticZymes于2005年在Olso证券交易所上市，精于规模化生产独特特性的酶产品。
在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。AAV衣壳亚种之间因表面电荷的差异导致不同的的等电点，——空衣壳pI在6.3左右，包装了完整基因组DNA后的病毒颗粒pI大致为5.9。而来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，SAN HQ高盐核酸酶pI 9.6左右。因此，在同样的条件下，从AAV溶液中去除SAN HQ高盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。SAN HQ高盐核酸酶在低温下也能保持高活性。青海SAN HQ TF高盐核酸酶
高盐能够抑制AAV病毒载体聚集，提高AAV病毒载体产量。天津上海倍笃生物高盐核酸酶70921-202
Mayer等（2023）以measles virus(麻疹病毒，MV)为例，评估了四种不同核酸酶（BenzonaseTM、DeneraseTM、M-SAN HQ中盐核酸酶及SAN HQ高盐核酸酶）对于染色质DNA去除的效果。Vero细胞通过微载体贴壁培养来生产麻疹病毒MV，72hr后收获上清液，使用3µm cellulose filter(Sartorius)过滤后分装多份，置于-80℃保存便于后续使用。在解冻后的上清中调节对应盐浓度，并加入50 U/ml核酸酶，37℃孵育2hr进行消化，消化后留样；将消化后上清液过Capto Core 700 (Cytiva)柱子，收集流穿液，之后洗杂、洗脱，并分别留样。通过SDS-PAGE分析发现，相比Benzonase等传统核酸酶，在生理盐条件下M-SAN HQ中盐核酸酶更高效将染色质DNA剪切成更小片段，甚至将核小体DNA剪切更彻底。天津上海倍笃生物高盐核酸酶70921-202
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