第二种***使用的DNA染色方法是Hoechst染料，**初由化学公司HoechstAG生产。Hoechst33258、Hoechst33342和Hoechst34580都是邻苯二甲酰亚胺，具有向A-T富集区插入的趋势，因此后者不常使用。与DAPI相似，此类染料受到紫外线激发并在455nm下发射比较大值，在无结合状态下变为510–540nm。Hoechst染料还具有细胞渗透作用，因此可用于固定细胞和活细胞。与DAPI不同是，Hoechst染料毒性更低。DNA染色剂碘化丙啶无法透过细胞膜。在细胞培养中，因为该染色剂无法进入完好的细胞内，所以常常被用来区分活细胞和死细胞。碘化丙啶也是一种结合剂，但对不同的碱基没有特异性。在核酸结合态下，其比较大激发波长为538nm，比较高发射波长为617nm。未结合状态下碘化丙啶的比较大激发和发射被移到较短的波长和较弱的强度。它也可以在不改变其荧光特性的情况下与RNA结合。要区分DNA和RNA，必须使用足够的聚合酶。Hoechst 33342是一种可透过细胞膜并对DNA染色的细胞核染色试剂，它在嵌入双链DNA后释放强烈的蓝色荧光。光敏剂荧光染料DIO
选择荧光染料时要考虑那些因素：激发波长处的消光系数应尽可能高：消光系数是衡量可以吸收多少光子的量度。量子产率应该尽可能高：这是吸收光子与发射光子的比率。消光系数和量子产率的乘积就是亮度。荧光染料应该是光稳定的：遗憾的是，比较不同公司染料的光稳定性的研究并不多。光致变色行为：对于STORM实验，您需要一个闪烁的荧光团。但是，对于分子跟踪实验，您***不想要闪烁的荧光团。活/死细胞渗透性。您想要的反应侧基（例如HaloTag、抗体等）。当您使用多个荧光探针时，尤其是当您量化共定位时，请谨慎处理其他颜色通道中的渗色。单独测试所有荧光探针以评估渗透。黑龙江荧光染料IR825Super Fluor 555（效果同Alexa Fluor 555）琥珀酰亚胺酯荧光染料。
与花青和罗丹明染料一样，荧光素也是一种有机染料。荧光素的比较大吸收波长为494nm，比较大发射波长为521nm（通常吸收蓝色范围内的光并发射绿色范围内的光），荧光素是一种高荧光物质。即使在非常少量的情况下也可以检测到它，并且在与抗体结合时用于显微镜检查。荧光素的衍生物包括异硫氰酸荧光素、俄勒冈绿和羧基萘并荧光素等。与许多其他荧光染料一样，荧光素价格低廉且易于使用，使其成为生物学研究中很受欢迎的染料之一。与大多数其他染料不同，荧光素在水溶液中是无毒的。因此，它是极少数用作地下水示踪剂的染料之一。
荧光染料在细胞实验中具有广泛的应用1、细胞膜标记：可以使用荧光染料标记细胞膜，以观察和研究细胞膜的动态和结构变化。2、染色体和DNA标记：用荧光染料标记染色体或DNA，可以观察和分析DNA复制、转录、修复等过程3、蛋白质标记：通过荧光染料标记蛋白质，可以研究蛋白质的相互作用、定位和运动等特性。4、细胞器标记：使用特定波长的荧光染料可以标记和可视化细胞中的线粒体、溶酶体等细胞器。5、神经科学应用：荧光染料在神经科学中也有广泛应用，如标记神经元和突触，观察神经信号的传递等。6、基因表达分析：通过荧光染料标记基因表达产物，可以定量分析基因的表达水平和细胞中的分布情况。南京星叶生物科技有限公司Super Fluor系列（效果同Alexa Fluor 系列）。
Cy5:激发波长633/635nm，比较大发射波长670nm。1)其标记的抗体适用于所有配备633nm氟离子激光器的流式细胞仪;2)在流式细胞仪的FL4通道检测;3)适用于荧光显微镜技术;4)同样为小分子染料，非常适合需小分子染料的流式细胞术，荧光强度低于APC。5)与单核和粒细胞非特异性结合多，易出现假阳性结果。
5、PE:激发波长488nm，比较大发射波长575nm。1)其标记的抗体适用于所有配备488nm氯离子激光器的流式细胞仪:2)在流式细胞仪的FL2通道检测;3)其荧光泯灭性强，不适用于传统的荧光显微镜技术，但适用于激光共聚焦显微镜技术。
6、PE-TR:激发波长488nm，比较大发射波长615nm。1)在BeckmanCoulter流式细胞仪的FL3通道检测;2)可适用于小功率激光器的流式细胞仪，也可使用于大功率激光器的大流式细胞仪。
7、PE-AlexaFluor610:激发波长488nm，比较大发射波长628nm。1)在BeckmanCoulter流式细胞仪的FL3通道检测;2)荧光强度高;3)可适用于小功率激光器的流式细胞仪，也可使用于大功率激光器的大流式细胞仪。 罗丹明123一种可对活细胞线粒体染色的细胞染色试剂。细胞膜荧光染料DIO
Super Flour 系列荧光探针，具有更强的荧光强度，更广的pH应用范围（pH 4～10）, 更好的抗淬灭性。光敏剂荧光染料DIO
光热***是另一个吲哚菁绿的重要应用领域。在光热***中，吲哚菁绿可以被引入**组织，并在近红外激光的照射下吸收光能转化为热能，从而使**组织受到热损伤，达到***的效果。吲哚菁绿的荧光性质使得其在光热***中具有很高的选择性，可以精确地破坏**组织而对正常组织几乎没有影响。这种精细的***方式有助于减少***的副作用，提高***效果。吲哚菁绿在生物识别和药物输送方面也有广泛的应用。在生物识别中，吲哚菁绿可以与特定的生物分子结合，通过检测其荧光信号来实现对这些生物分子的定量分析。这种技术在生物医学研究、药物筛选和疾病诊断中具有重要的意义。另外，吲哚菁绿还可以作为药物输送系统的一部分，将药物包裹在其分子结构中，并通过光***释放药物，实现对疾病靶点的精确***。吲哚菁绿作为一种具有优良绿色溶解度的荧光染料，在医学和生物领域发挥着重要的作用。它的应用领域涉及医学影像学、光热***、生物识别和药物输送等方面，并且具有较高的选择性和精细性。随着科学技术的不断进步，相信吲哚菁绿将在未来更***地应用于临床实践中，为人类的健康和医学科研做出更大的贡献。光敏剂荧光染料DIO
