引入特定基团增加空间位阻：以一个兼顾光稳定性和水溶性的五甲川吲哚菁染料为母体，在中间共轭甲川直链引入氯原子和溴原子来增加染料分子的空间位阻，从而增强染料的光稳定性。由此合成出来了一系列新型近红外菁染料，且这类菁染料的斯托克斯位移大于普通多甲川菁染料24。引入大空间位阻基团提高光稳定性：设计合成的染料是以吲哚为母核，通过在母核的N原子上引入空间位阻大的苄基及其衍生物来提高染料的光稳定性。循环伏安测试表明，合成的五甲川吲哚菁染料相对于中间共轭链有环己烯的七甲川菁染料有更好的光稳定性，同时也证明在吲哚环N原子引入苄基及其衍生物确实比引入直链烷基有更好的稳定性24。电压敏感型荧光染料标记机制。江西荧光染料APC
DiI染料标记机制DiI（1,1'-dioctadecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanineperchlorate）是一种亲脂性的荧光染料，常用于神经元标记。在大鼠中，通过结晶状的荧光DiI可以对牙初级传入神经元（DPANs）进行逆行荧光标记。在小鼠中，虽然也可以使用DiI进行标记，但之前*能使用Fluoro-Gold这种具有神经毒性的荧光染料，且其膜穿透特性优于碳菁染料。后来研究人员对DiI在大鼠中的标记技术进行了重新评估，旨在将其应用于小鼠。新型的DiI配方具有改进的穿透性能和染色效率，可以评估轴突染料从应用部位到三叉神经节的运输速度、染色的DPANs数量以及荧光强度。其标记机制主要是利用DiI的亲脂性，能够与神经元细胞膜结合，随着轴突的运输而扩散到神经元的各个部位，从而实现对神经元的标记。荧光素钾盐荧光染料激发近红外荧光染料在实际应用中可能会受到氧气等氧化剂的影响。
优化合成方法：寻找替代溶剂合成 “Nile Red”：“Nile Red” 是一种荧光、亲脂性有机染料，用于荧光显微镜中选择性识别微塑料以及在生物研究中用于细胞内脂质的定位和定量。由于对 N,N - 二甲基甲酰胺（DMF）溶剂的使用限制，需要优化一种基于另一种溶剂的方法来合成 “Nile Red”，同时保持化合物的比较好成本。通过对不同有机溶剂的筛选，发现甲醇作为替代溶剂时，“Nile Red” 的 HPLC 产率较高。合成的 “Nile Red” 纯度为 94%，适用于荧光显微镜23。
肿瘤细胞成像：近红外荧光染料IR-780具备使多种肾透明细胞*细胞显像的能力，对正常肾胚上皮细胞则无此能力，可用于血液中肾透明细胞*细胞的特异性诊断。这为肿瘤细胞的检测和诊断提供了新的方法21。疾病标志物检测：设计合成的近红外荧光探针RB-Phenylacrylate(NOF1)，用于高选择性和高灵敏度检测半胱氨酸(Cys)，并成功应用于活细胞、斑马鱼和小鼠中半胱氨酸的近红外荧光成像检测。近红外荧光探针RB-Phenyldiphenylphosphinate(NOF2)用于过氧亚硝酸根的荧光成像，实现了活细胞和小鼠炎症模型中ONOO⁻的荧光成像检测。这些探针为疾病标志物的检测和成像提供了新的手段23。四、支持超分辨率成像新型近红外氧杂蒽荧光染料如KRhs，可用于超分辨率成像。KRhs显示出强烈的近红外发射峰，在700nm处具有高荧光量子产率，且在没有增强缓冲液的帮助下，表现出随机荧光开关特性，支持单荧光团的时间分辨定位。KRhs被功能化为KRh-MitoFix、KRh-Mem和KRh-Halo，分别具有线粒体、质膜和融合蛋白靶向能力，可用于活细胞中这些目标的超分辨率成像20。动物成像技术不仅在医学研究中具有重要应用，还可以拓展到其他领域。
控制pH值荧光染料的荧光强度通常会随pH值的变化而变化。WangChao-xia在2010年的研究中指出，对于荧光黄染料，荧光强度随着pH值的增加而降低，当pH值在7～9时，荧光强度基本保持不变34。这表明在实际应用中，可以通过调节溶液的pH值来优化荧光染料的性能。不同的荧光染料对pH值的敏感性可能不同，因此在使用荧光染料时，需要了解其在不同pH值下的性能变化规律，并根据实际需求进行pH值的调整。例如，在生物医学领域，细胞内的pH值环境可能会影响荧光染料的性能，因此需要选择对pH值变化不敏感或在特定pH值范围内具有良好性能的荧光染料。控制溶剂溶剂的性质也会对荧光染料的性能产生影响。例如，在某些情况下，加入适量的酒精溶剂可能会降低荧光染料的荧光强度。WangChao-xia的研究表明，当向荧光黄染料中加入3%的酒精溶剂时，荧光强度降低约10%34。此外，溶剂的极性、粘度等性质也可能会影响荧光染料的荧光性能。在实际应用中，需要根据荧光染料的特性选择合适的溶剂，并控制溶剂的性质以提高荧光染料的性能。近红外荧光染料在稳定性测试中表现出多种差异，不同结构的染料在化学稳定性、光稳定性等方面各具特点。山西荧光染料Fluor 555
不同结构修饰的噁嗪衍生物荧光染料在神经与其他组织的对比度上也存在差异。江西荧光染料APC
实时动态成像实时动态成像对于研究动物体内的生理和病理过程具有重要意义。通过将PET动态成像技术应用于高吞吐量多鼠成像方法，可以同时获取动态脑图像4。这为研究动物大脑的功能连接和神经活动提供了新的途径。动物成像技术还可以结合基因编码的神经调节工具，实现对动物大脑活动的实时监测和调控13。这将有助于深入了解动物的行为和认知过程，以及神经系统疾病的发生机制。四、标准化和质量控制小动物成像的标准化对于提高数据的有效性和可靠性至关重要。使用小动物成像设备的标准化，以及一般的动物处理，是确保数据可重复性和可靠性的关键14。例如，提供有效的小动物成像质量控制的指导，使用幻像建立质量控制计划，可以标准化多中心研究或多扫描仪的图像质量参数。在动物实验中，需要解决由于动物处理引起的额外复杂性，以确保标准化的成像程序。实施标准化的动物神经成像协议将促进动物群体成像努力以及元分析和复制研究，提高研究结果的可比性和可靠性。江西荧光染料APC
