RNA提取围绕DEPC的玄学。单纯高压过的蒸馏水或超纯水,基本可以视为无核酸酶活性等级的水。Thermo Fisher公司曾经做一项实验来说明这个问题。在PBS中加入不同浓度RNase A,高压或不高压,后溶解P-32标记RNA 探针。较后数据显示,除非原始的RNase A的浓度高达1 µg/ml,否则常规高压过的水,基本检测不出RNase A活性。当然,Thermo的科学家也很谨慎,说这个结论*适用于RNase A,不能推广到其他的RNase类型。不使用DEPC来处理RNA实验相关试剂和耗材,因为太费劲,而且DEPC还有毒性。相关的液体试剂,我会使用从公司购买的Nuclease-free的水来配制。没有很贵,一小瓶够用很久。很多时候买各种其他试剂,比如酶、siRNA等,也都会送这样的水。在耗材方面,直接使用大公司的离心管和吸头,根本不用担心核酸酶的问题。RNA 的产量和质量也是另无数人头疼的问题。长沙RNA提取试剂供应商
RNA提取真正需要注意的要点:你的植物组织样本采样、保存正常吗?组织裂解充分了吗?组织起始量是否过大?起始量过大的话,他们得带进去多少RNase呀,导致裂解液不能充分压制内源性的RNase,失败就在预料之中!你的细胞活性好吗?细胞都到衰亡期了,你提什么RNA呀;细胞加的那么多,破壁不充分,怎么裂解的好呢,他们本身得带进去多少内源性RNase污染呀!转移液体时吸到沉淀了吗?吸水相时碰到中间层了吗?乙醇干燥净了吗?裂解样本的过程是重中之重液氮研磨(手工):要先加液氮预冷一下研钵,然后研磨,研磨过程要保证研钵中一直有少量液氮,研磨完成一个样本后,直接加入裂解液涡旋震荡后放常温,或者直接丢到液氮中,全部研磨后一起加裂解液。液氮研磨(研磨仪):研磨模块丢到液氮中预冷,直到没有气泡冒出视为预冷完毕。在2ml圆底离心管(不需要无酶管,液氮研磨中不破裂就好)中加入5mm钢珠一粒,放进样品,投入液氮中预冷。把所有预冷好的离心管**研磨模块中,放进研磨机震荡20-30秒。完成后马上加裂解液,涡旋。上海正规RNA提取试剂厂家批发价RNA定量方法与DNA定量相似。
在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。细胞中还有许多种类和功能不一的小型RNA,像是组成剪接体的snRNA,负责rRNA成型的snoRNA,以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。而其他如I、II型内含子、RNaseP、HDV、核糖体RNA等等都有催化生化反应过程的活性,即具有酶的活性,这类RNA被称为核酶。在病菌方面,很多病菌只以RNA作为其中的遗传信息载体(有别于细胞生物普遍用双链DNA作载体)。
那RNA到底是什么呢?它又和基因有什么关系呢?基因的表达.其实人体内的RNA主要和基因的表达有关系。不知道你思考过这么一个问题没有,基因是我们体内的遗传物质,它如何来表达自己呢?事实上,这个过程是需要用到RNA的。具体来说是这样的,由于染色体是存在于细胞核当中的,而根据上述的内容,我们知道,基因其实是存在于染色体上的。如果一个基因要表达,只有两种办法,一个就是它亲自到细胞核外去完成一切的生命活动,另一个办法就是找个帮手来完成。而我们的基因选择的是第二条路径,也就是找一个帮手,这个帮手就是RNA,更准确地说是信使RNA(mRNA),基因会通过转录,利用碱基互补原则,合成一条信使RNA,这个过程都是在细胞核内部完成的。普通的提取实验用国产的试剂盒就足以,价格不高,基本上各地均有现货。
RNA的提取:众所周知,Trizol是一种RNA提取试剂,内含异硫氰酸胍和酚等物质,能迅速破碎细胞和溶解细胞中的其他成分,压制细胞释放出核酸酶,维持细胞中RNA的稳定性,我们可以在反应物中加入Trizol后摇匀,在加入氯仿离心,这样的话我们的RNA就进入了水相中,再用异丙醇沉淀水相中的RNA,即可达到提取总RNA的目的了。首先我们需要称取一定量的预处理好的废酵母配10%左右的酵母溶液,在一定温度下,加入一定浓度的氯化钠,之后加入NaOH溶液调节反应的pH,搅拌抽提一定时间后,离心分离上清液,调节pH至等电点,经酒精沉淀获得核糖核酸,用水定容至100mL取1m适当稀释,调pH7.0,这样的话RNA就出现了,分别测定吸光值A260和A280并计算A260/A280,就可以测定RNA的提取率了。当然啦,我们还可以进行深入研究,如测定Nacl的浓度,PH的大小,以及抽提时间对RNA提取率的影响啦。β-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。宁波珠海RNA提取试剂
tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者。长沙RNA提取试剂供应商
RNA提取:预备工作(1)塑料制品:尽量使用一次性无菌塑料制品。已标明RNase-free的塑料制品,如没有开封使用过,通常不必再处理。处理的步骤如下:O在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使其终浓度为0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。(DEPC二乙基焦碳酸酯为活性很强的剧毒物,须在通风橱中小心使用)O将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC-H2O,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,在通风柜中37℃ 或室温下处理过夜。O 将DEPC-H2O小心倒入废液瓶中,将装有DEPC- H2O 处理过的塑料制品的容器以铝箔封口,高温高压蒸汽灭菌至少30分钟。O 灭菌塑料制品烘烤干燥,置洁净处备用。(2)玻璃和金属物品250 ℃烘烤3小时以上。长沙RNA提取试剂供应商
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RNA提取:主要试剂Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。1.Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2.RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3.细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低较后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时较好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。4.酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧...