RNA提取醇沉淀不是越多就越好。有些实验方案会推荐,在异丙醇沉淀后,用乙醇沉淀两次。实际上,任何提取实验,都会在纯度和得率这一对矛盾中取舍。醇沉淀会将脂溶性杂质去掉,但部分非脂溶性的杂质依然会连同RNA一起被沉淀下来。因此,多整几次,并不会让RNA的纯度翻倍,反而还会有降低得率的风险。一般情况下,异丙醇和乙醇各沉淀一次即可。但是,倘若预计RNA浓度很低,那就只能放弃纯度,在低温沉淀数小时,以换来较高的得率。围绕DEPC的玄学。许多实验方案会推荐使用0.1% DEPC处理RNA相关用水,以灭活RNase。这一点是要肯定的。不过,在使用DEPC的过程中,又充斥着一些玄学。高压灭菌后的DEPC水,会有一股“香甜”的味道。许多人会以为那是残留的DEPC而不敢用。实际上,这只是DEPC分解成CO2和乙醇后,产生的一些挥发性酯类副产物。rRNA是组成核糖体的部分,而核糖体是蛋白质合成的场所。芜湖南昌RNA提取试剂
经典Trizol法并不能获得总RNA:这个事实可能会刷不少新手甚至老手的三观,但确有实验支持:经典Trizol法会选择性丢失低GC比的miRNA。这一点,源自一则作者自撤稿的故事。V. Narry Kim是韩国鼎鼎大名的美女科学家,专做RNA相关的研究,包括miRNA。几年前她们组发现一个奇怪的“现象”,即贴壁细胞在消化之后,会有一些miRNA的丰度突然降低,看起来好像是被快速“降解”掉了,并据此写了一篇文章发到Molecular Cell上。但很快她们就发现,这个“现象”难以重复:如果用Trizol做实验,就一定是阳性结果,而用试剂盒提RNA,就重复不出来。难道是号称能提总RNA的Trizol方案出了问题?确实如此。经进一步实验后发现,经典的Trizol方案会使得低GC比的miRNA丢失。芜湖正规RNA提取试剂供应商常用RNA提取方法有:1TRIzol法;2TRIzol+过柱法;3CTAB+过柱法;4试剂盒法。
mRNA:是蛋白质合成(翻译)过程中的模版,蛋白质分子中氨基酸的排列顺序,就是由mRNA上每3个相邻的核苷酸形成的密码子的排列顺序决定的;tRNA:的作用是在蛋白质的合成过程中转运氨基酸,为蛋白质的合成提供原料;并可准确识别其所转运的氨基酸在mRNA上的密码子;rRNA:主要是和一些蛋白质组装成一类重要的细胞器——核糖体,而核糖体就是蛋白质合成的场所——“装配车间”。所以三种RNA的作用主要是参与蛋白质的生物合成。tRNA上的反密码当然应能识别mRNA上相应的、互补的密码,并与之配对。然而用提纯的tRNA来进行实验时,发现一种tRNA能够识别几种密码。例如,丙氨酸tRNA,其反密码为IGC(5′>3′),可以识别三种密码。rRNA与多种蛋白质分子共同构成**白体。**白体相当于“装配机”,能促使tRNA所携带的氨基酰基缩合成肽。**白体附着在mRNA上,并沿着mRNA长链的起始信号向终止信号移动。至于rRNA在蛋白质生物合成中的具体作用还不清楚。
RNA的提取:众所周知,Trizol是一种RNA提取试剂,内含异硫氰酸胍和酚等物质,能迅速破碎细胞和溶解细胞中的其他成分,压制细胞释放出核酸酶,维持细胞中RNA的稳定性,我们可以在反应物中加入Trizol后摇匀,在加入氯仿离心,这样的话我们的RNA就进入了水相中,再用异丙醇沉淀水相中的RNA,即可达到提取总RNA的目的了。首先我们需要称取一定量的预处理好的废酵母配10%左右的酵母溶液,在一定温度下,加入一定浓度的氯化钠,之后加入NaOH溶液调节反应的pH,搅拌抽提一定时间后,离心分离上清液,调节pH至等电点,经酒精沉淀获得核糖核酸,用水定容至100mL取1m适当稀释,调pH7.0,这样的话RNA就出现了,分别测定吸光值A260和A280并计算A260/A280,就可以测定RNA的提取率了。当然啦,我们还可以进行深入研究,如测定Nacl的浓度,PH的大小,以及抽提时间对RNA提取率的影响啦。RNA定量方法与DNA定量相似。
与DNA不同,RNA一般为单链长分子,很多RNA也需要通过碱基配对原则形成一定的二级结构乃至三级结构来行使生物学功能。RNA是以DNA的一条链为模板,以碱基互补配对原则,转录而形成的一条单链,主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达,是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。在此过程中,转运RNA是携带与三联体密码子对应的氨基酸残基与正在进行翻译的mRNA结合,而后核糖体RNA将各个氨基酸残基通过肽键连接成肽链进而构成蛋白质分子。有些生物,例如一些病菌,也直接使用RNA作为遗传信息的载体,而不是DNA。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录。徐州RNA提取试剂厂家
一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。芜湖南昌RNA提取试剂
提取RNA的详细步骤:首先,将研钵晾干够,倒入1/3体积的液氮,加入0.2g均质的植物材料,充分研磨后转入一个含有300微升GMT的1.5ml的离心管中,摇匀。然后,加入30微升2mol/lNaAc进行摇匀,加入300微升酸酚摇匀,加入100微升的氯仿摇匀。然后,在四摄氏度12000r/min下离心二十分钟,吸取上清液的3/4,加入等体积的异丙醇,于冰上放置十五分钟。然后,在四摄氏度12000r/min下离心十分钟,将沉淀悬浮于含100微升的4mol/lLiCl小试管中,于-20摄氏度下放置过夜。然后,在4摄氏度13000r/min下离心10-15min,将沉淀溶于0.4mlDEPC处理水中,加入1/2体积氯仿和1/2体积酸酚,摇匀,进行抽提,在4摄氏度13000r/min下离心五分钟。将上清液中加入等体积的氯仿摇匀,进行抽提,在四摄氏度13000r/min下离心五分钟,上清液中加入1/10体积3mol/l NaAc和两倍体积的午睡乙醇与-20摄氏度放置一小时。芜湖南昌RNA提取试剂
RNA提取:主要试剂Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。1.Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2.RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3.细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低较后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时较好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。4.酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧...