经典Trizol法并不能获得总RNA:这个事实可能会刷不少新手甚至老手的三观,但确有实验支持:经典Trizol法会选择性丢失低GC比的miRNA。这一点,源自一则作者自撤稿的故事。V. Narry Kim是韩国鼎鼎大名的美女科学家,专做RNA相关的研究,包括miRNA。几年前她们组发现一个奇怪的“现象”,即贴壁细胞在消化之后,会有一些miRNA的丰度突然降低,看起来好像是被快速“降解”掉了,并据此写了一篇文章发到Molecular Cell上。但很快她们就发现,这个“现象”难以重复:如果用Trizol做实验,就一定是阳性结果,而用试剂盒提RNA,就重复不出来。难道是号称能提总RNA的Trizol方案出了问题?确实如此。经进一步实验后发现,经典的Trizol方案会使得低GC比的miRNA丢失。当然还有其它的进口试剂盒,但是均存在价格高、订货周期长的问题。长沙RNA提取试剂哪家好
Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,采用变性剂即内含异硫氰酸胍酚和β-巯基乙醇等变性物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,**白迅速与核酸分离。β-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。细胞裂解后,细胞释放出蛋白质、DNA、RNA等物质,再根据它们在不同的PH值和不同极性溶剂的溶解度不同而使得分开。RNA的定量计算1.RNA定量方法与DNA定量相似。RNA在260nm波长处有较大的吸收峰。因此,可以用260nm波长分光测定RNA浓度,OD值为1相当于大约40μg/ml的单链RNA。如用1cm光径,用 ddH2O稀释DNA样品n倍并以ddH2O为空白对照,根据此时读出的OD260值即可计算出样品稀释前的浓度:RNA(mg/ml)=40×OD260读数×稀释倍数(n)/1000。2. RNA纯品的OD260/OD280的比值为2.0,故根据OD260/OD280的比值可以估计RNA的纯度。若比值较低,说明有残余蛋白质存在;比值太高,则提示RNA有降解。珠海正规RNA提取试剂价格可从全血,哺乳动物细胞,细菌细胞和菌类细胞中分离总RNA。
对RNA的科学研究,首先要从植物或者动物等组织中提取出合格的RNA。在实际RNA提取中,有几个提取原则:1、保证RNA一级结构的完整性;2、提取的RNA样品中不应存在对酶存在压制作用的有机溶剂及过高浓度的金属离子;3、其他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应降低到较低程度;4、排除其它核酸分子(DNA)的污染。常用RNA提取方法有:1TRIzol法;2TRIzol+过柱法;3CTAB+过柱法;4试剂盒法。RNA提取试剂盒Biomarker Plant Total RNA Isolation Kit (Polysaccharides&Polyphenolics–rich),能从植物组织,特别是富含多糖多酚或淀粉的植物组织(如成熟水稻叶片,棉花叶片,拟南芥种子,香蕉,马铃薯块茎,苹果,西瓜果肉,猕猴桃,梨,月季等)中快速提取总RNA,同时可以处理大量不同样品。
RNA提取醇沉淀不是越多就越好。有些实验方案会推荐,在异丙醇沉淀后,用乙醇沉淀两次。实际上,任何提取实验,都会在纯度和得率这一对矛盾中取舍。醇沉淀会将脂溶性杂质去掉,但部分非脂溶性的杂质依然会连同RNA一起被沉淀下来。因此,多整几次,并不会让RNA的纯度翻倍,反而还会有降低得率的风险。一般情况下,异丙醇和乙醇各沉淀一次即可。但是,倘若预计RNA浓度很低,那就只能放弃纯度,在低温沉淀数小时,以换来较高的得率。围绕DEPC的玄学。许多实验方案会推荐使用0.1% DEPC处理RNA相关用水,以灭活RNase。这一点是要肯定的。不过,在使用DEPC的过程中,又充斥着一些玄学。高压灭菌后的DEPC水,会有一股“香甜”的味道。许多人会以为那是残留的DEPC而不敢用。实际上,这只是DEPC分解成CO2和乙醇后,产生的一些挥发性酯类副产物。mRNA是依据DNA序列转录而成的蛋白质合成模板。
核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病菌、类病菌中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T。核糖核酸在体内的作用主要是引导蛋白质的合成。人体一个细胞含RNA约10pg(含DNA约7pg)。与DNA相比,RNA种类繁多,分子量较小,含量变化大。RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA。非编码RNA分为非编码大RNA和非编码小RNA。非编码大RNA包括核糖体RNA、长链非编码RNA。非编码小RNA包括转移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA(20~300nt)包括 miRNA、 SiRNA、 piRNA、scRNA、 snRNA、 snoRNA等,细菌也有小分子RNA(50~500nt)。rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。珠海正规RNA提取试剂价格
纯的RNA用RE缓冲液洗脱,不用酚提取或醇沉淀。长沙RNA提取试剂哪家好
RNA提取:预备工作(1)塑料制品:尽量使用一次性无菌塑料制品。已标明RNase-free的塑料制品,如没有开封使用过,通常不必再处理。处理的步骤如下:O在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使其终浓度为0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。(DEPC二乙基焦碳酸酯为活性很强的剧毒物,须在通风橱中小心使用)O将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC-H2O,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,在通风柜中37℃ 或室温下处理过夜。O 将DEPC-H2O小心倒入废液瓶中,将装有DEPC- H2O 处理过的塑料制品的容器以铝箔封口,高温高压蒸汽灭菌至少30分钟。O 灭菌塑料制品烘烤干燥,置洁净处备用。(2)玻璃和金属物品250 ℃烘烤3小时以上。长沙RNA提取试剂哪家好
RNA提取:主要试剂Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。1.Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2.RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3.细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低较后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时较好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。4.酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧...