自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。上海沃本--专业的肠道菌群检测**。广东肠道菌群检测查什么
肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究,发现类风湿关节炎(RA)的发生与肠道屏障功能的受损密切相关,新发病RA患者的血清连蛋白表达增加,而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中,肠道炎症发生早于关节炎的发病,而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示,靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者,发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高;②纵向研究结果显示,血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高;③RA患者(包括新发病患者)肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白(包括occludin与claudin-1)表达明显降低;④在胶原诱导的关节炎(CIA)小鼠模型中,肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前;⑤丁酸盐处理降低肠道通透性,或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。山东肿瘤术后菌群检测查什么上海沃本--您身边的肠道菌群检测**
AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对类风湿关节炎(RA)患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析,鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能,并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联,提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎(RA)患者及42名健康对照,对肠道菌群进行全基因组深度测序;②RA患者的肠道菌群宏基因组中,普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人;③RA患者的肠道菌群宏基因组中,R6FCZ7(与氧化还原反应相关的基因)的丰度明显低于健康人,而代谢相关通路(脂肪酸生物合成、粘多糖降解等)明显富集;④通过对比宏基因组关联分析(MWAS)与全基因组关联分析(GWAS),鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。
药物微生物组学是一门新兴学科,关注药物与菌群之间的复杂互作。Nature Reviews Rheumatology上发表的一篇综述文章,详细介绍了在炎症性关节炎(包括类风湿关节炎、银屑病关节炎及强直性脊柱炎)中,肠道菌群如何通过调节药物的生物利用度、活性及毒性,以影响药物的改善效果,并讨论了如何将药物微生物组学应用于炎症性关节炎的精细医疗之中。①在多种疾病中,药物-菌群互作可影响患者对药物改善的应答;②肠道菌群及其代谢产物可调节炎症性关节炎改善药物的生物利用度、临床疗效及毒性;③例如,柳氮磺胺吡啶可被肠道菌群代谢为活性形式,而甲氨蝶呤可被肠道菌群代谢为非活性形式;④药物微生物组学研究用于炎症性关节炎精细医疗的潜在策略包括:肠道菌群作为预测改善应答的生物标志物、调控菌群以增加药物的生物利用度及疗效、抑制特定细菌酶活性以防止其将药物代谢为毒性产物。肠道菌群检测--解读人类“第二基因组”。
AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对比了强直性脊柱炎患者与健康人的粪便菌群组成差异,并发现患者粪便中潜在的交叉反应性细菌表位的富集,同时,抗TNF改善与患者菌群的恢复、交叉性细菌表位的减少相关。①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。肠道菌群检测常用的方法?浙江专业菌群检测查什么
如何确定肠道菌群失调?广东肠道菌群检测查什么
安徽医科大学的李宝珠团队Rheumatology上发表的一篇系统性综述,纳入26项研究的结果,总结了类风湿关节炎(RA)患者的口腔菌群与肠道菌群的组成及多样性的变化。①总结26项研究的结果,分析RA患者的口腔菌群与肠道菌群变化;②3项以上的研究报道,与对照相比,早发性RA/RA患者的肠道菌群中的粪杆菌属减少,而口腔菌群中的普氏菌属增加,链球菌属及嗜血杆菌属减少;③另外,部分普氏菌属中的物种(包括P.histicola及P.oulorum)在RA患者的口腔菌群中有增加趋势;④RA患者的口腔菌群α-多样性增加或不变,而肠道菌群α-多样性降低或不变。广东肠道菌群检测查什么
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