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自从引入了细菌的基因组学分析以来，针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法，常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异，因为这种差异通常很小。相反地，宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组，这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。上海沃本--目前肠道菌群检测的靠谱产品。陕西肠道菌群检测科研助力

来自广东省中医院的黄闰月团队与黄清春团队在Frontiers in Immunology上发表的一项研究，对比了类风湿关节炎（RA）患者与健康对照的肠道菌群组成及功能差异，并对比了接受不同药物***后，RA患者的肠道菌群组成及功能的变化。①纳入22名RA患者及22名健康对照，13名患者接受化瘀强肾通痹方（HQT）+甲氨蝶呤，9名患者接受来氟米特（LEF）+甲氨蝶呤；②相比于健康对照，RA患者分别有的37个及21个肠道细菌物种富集或减少，维生素K2生物合成与RA患者中富集的细菌相关；③HQT组与LEF组患者的临床疗效相似，HQT影响红细胞沉降率，LEF影响C反应蛋白水平；④用药后，HQT组及LEF组患者分别有11个及4个肠道细菌物种，以及9个及2个菌群代谢通路发生变化。山东神经类疾病菌群检测私人定制肠道菌群检测--高通量测序平台的应用。

AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项研究，对类风湿关节炎（RA）患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析，鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能，并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联，提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎（RA）患者及42名健康对照，对肠道菌群进行全基因组深度测序；②RA患者的肠道菌群宏基因组中，普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人；③RA患者的肠道菌群宏基因组中，R6FCZ7（与氧化还原反应相关的基因）的丰度明显低于健康人，而代谢相关通路（脂肪酸生物合成、粘多糖降解等）明显富集；④通过对比宏基因组关联分析（MWAS）与全基因组关联分析（GWAS），鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。

菌群在风湿病及其它自身免疫疾病的发***展中发挥重要作用。AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一篇综述文章，介绍了一些在风湿病及自身免疫疾病领域中的标志性菌群研究，并讨论了风湿病相关菌群研究中存在的机会与挑战，展望了将菌群研究应用于风湿病诊疗中的未来可能。①肠道菌群是触发和驱动自身免疫疾病必需的，自身免疫疾病患者的肠道菌群多样性降低，拟杆菌属等减少，共生致病菌（梭杆菌属等）升高；②药物微生物组学可改善风湿病药物的选择；③通过饮食、益生菌/元等间接调节菌群或可改善风湿病，例如地中海饮食可能对类风湿关节炎有益，益生元可能缓解脊柱关节炎；④通过粪菌移植直接调节菌群也可能改善风湿病，但目前还缺乏决定性证据；⑤菌群研究有助于风湿病和自身免疫性疾病的精细调节。如何确定肠道菌群失调？

肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究，发现类风湿关节炎（RA）的发生与肠道屏障功能的受损密切相关，新发病RA患者的血清连蛋白表达增加，而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中，肠道炎症发生早于关节炎的发病，而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示，靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者，发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高；②纵向研究结果显示，血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高；③RA患者（包括新发病患者）肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白（包括occludin与claudin-1）表达明显降低；④在胶原诱导的关节炎（CIA）小鼠模型中，肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前；⑤丁酸盐处理降低肠道通透性，或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。肠道菌群检测常用的方法？山东肿瘤术后菌群检测准确性高

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强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化：①纳入127名强直性脊柱炎（AS）患者与123名健康人，对粪便菌群进行宏基因组测序；②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异，在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异；③抗TNF改善与AS患者的菌群变化（患者失调的菌群更趋近于健康人，包括一些与AS相关的菌种）相关；④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位（与HLA-B27呈递的表位相似）的富集，抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。陕西肠道菌群检测科研助力

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