免疫共沉淀分析(Co-IP)实验原理与IP十分类似,基本的技术都是采用目标抗原特异性的固相化抗体;但IP的目标是纯化单一抗原,而Co-IP旨在分离抗原及与抗原结合的蛋白质或配体。
在Co-IP实验中,已知抗原称为诱饵蛋白,与之结合的蛋白则称为靶蛋白。靶蛋白可能是一些复杂的伴侣蛋白、信号分子、结构蛋白、辅助因子等,蛋白间相互作用强度范围可能介于高度瞬时和十分稳定之间。基本的Co-IP实验方案与IP相同,实际上任何IP系统均可用于Co-IP。但是,还有许多其他因素需要考虑,例如,结合和洗涤条件的优化,优化时,需要考虑到诱饵蛋白-靶蛋白的相互作用强度以及抗体-诱饵蛋白的亲和力。
免疫沉淀技术的应用。广州RIP免疫沉淀磁珠原理
免疫沉淀实验步骤:
1. 样品制备
a. 悬浮细胞样品处理:离心收集细胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液(裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail,使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×)。混匀后置于冰上处理10 min;离心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上备用(或置于-20℃长期保存)。
b. 贴壁细胞样品处理:移去培养基,用PBS清洗细胞两遍;用细胞刮棒刮脱细胞,收集至1.5mL EP管内,按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液(裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail,使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×)。吹打数下,使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min;离心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上备用(或置于-20℃长期保存)。
4. 后续:磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱
广州RIP免疫沉淀磁珠原理免疫沉淀纯化所得抗原纯度低是什么原因?
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种强大的技术,用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用,尤其是在转录调控、DNA修复、复制以及表观遗传学领域。然而,像所有实验技术一样,ChIP实验也有其优点和缺点。
ChIP实验的优点:
1. 体内反应的反映:ChIP提供了一种在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法,能够真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息。
2. 全基因组覆盖:ChIP技术可以覆盖整个基因组,提供关于蛋白质-DNA相互作用的视图。
3. 适用于多种蛋白质:ChIP可以用来研究组蛋白修饰、转录因子以及其他DNA结合蛋白。
ChIP实验的缺点:
1. 实验步骤繁琐。
2. 需要大量起始材料:ChIP实验通常需要大量的细胞或组织作为起始材料。
3. 交联的影响:使用交联剂可能会改变蛋白质的结构,从而影响抗体的识别和蛋白质-DNA的相互作用。
4. 染色质碎裂的分辨率:染色质碎裂的效率和分辨率直接影响ChIP的准确性,需要优化以获得结果。
5. 抗体质量:抗体的质量对实验结果至关重要,但高质量、特异性强的抗体可能难以获得或成本较高。
免疫沉淀ChIP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
免疫沉淀技术RIP的应用有哪些?
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验设计概述:
1. 目标蛋白的选择:确定您想要研究的目标蛋白,例如特定的转录因子或组蛋白修饰。
2. 样本的准备:根据研究的需要选择合适的细胞或组织样本。
3. 抗体的选择:选择具有高特异性和亲和力的抗体,这对于实验的成功至关重要。
4. 交联:使用甲醛等交联剂将蛋白质与DNA在体内共价结合,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
5. 细胞裂解:裂解细胞以释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
6. 染色质的剪切:通过超声或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段,通常在200-1000 bp之间。
7. 免疫沉淀:使用特定抗体与目标蛋白结合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀复合物。
8. 洗涤和洗脱:洗涤沉淀物以去除未特异性结合的蛋白质和DNA,然后洗脱目标蛋白-DNA复合物。
9. 逆转交联:使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放DNA。
10. DNA的纯化和分析:纯化DNA并使用qPCR、芯片或测序技术(如ChIP-seq)进行分析。
免疫沉淀ChIP抗体的选择?苏州anti Flag免疫沉淀实验视频
免疫沉淀技术RIP是什么?广州RIP免疫沉淀磁珠原理
免疫沉淀实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
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